Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Несколько биоптатов с крысы - как анализировать?
Varta
сообщение 30.10.2008 - 10:00
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 20
Регистрация: 29.10.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 5459



Допустим имеем 2 группы по 6 крыс в каждой. У каждой крысы взято по 3 биоптата. Как анализировать?
Вариант 1 расчитать среднее по 3 биоптатам для каждой крысы и сравнить 6 и 6. (скажем, сделать Манна-Уитни)
Вариант 2 сравнить 18 биоптатов одной группы с 18 другой.
Правильно конечно делать первый вариант, поскольку при втором увеличивается вклад индивидуальной вариабельности и мы недооценим риск получить различия обусловленные случайной комбинацией крыс. Но чувствительность в первом варианте достаточно мала а хочется все-таки больше.
Есть какие-нибудь ещё варианты?

Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
Varta
сообщение 9.11.2008 - 10:23
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 20
Регистрация: 29.10.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 5459



Спасибо за объяснения, правда вникаю с трудом пока. smile.gif
Книгу скачаю, буду читать.

time*rat(group) - можно поподробнее? То есть time*group - этот эффект означает, что препарат изменяет динамику накопления коллагена (замедляет фибропластическую активность, скажем). time*rat(group) если будет достоверен, означает, что этот эффект препарата по разному выражен у разных крыс, допустим - у одних замедляет совсем чуть-чуть, у других сильно - я правильно понимаю?

Еще раз спасибо за подробные объяснения.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 10.11.2008 - 19:26
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(Varta @ 9.11.2008 - 13:23) *
time*rat(group) - можно поподробнее? То есть time*group - этот эффект означает, что препарат изменяет динамику накопления коллагена (замедляет фибропластическую активность, скажем). time*rat(group) если будет достоверен, означает, что этот эффект препарата по разному выражен у разных крыс, допустим - у одних замедляет совсем чуть-чуть, у других сильно - я правильно понимаю?

Да все так и есть. Взаимодействие time*group показывает насколько отличается динамика показателя в группах. Если оно значимо - динамики различны. Интересная особенность применения дисперсионного анализа для изучения различий в динамике - возможность анализировать любые динамики, в том числе те, для которых нет хороших моделей. Мы это уже обсуждали здесь в другой ветке посвященной анализу динамических процессов. Взаимодействие time*rat(group) отражает различия индивидуальных динамик у животных внутри группы. Да, у одних замедляет немного, у других сильно, а у некоторых может и ускоряет (если это теоретически возможно). Этот компонент сам по себе обычно не очень интересен и необходим в первую очередь для полноты разложения дисперсии в комплексе. Но помню анализировал данные по влиянию электростимуляции органов ЖКТ на скорость разрешения послеоперационного пареза. Так там индивидуальная изменчивость оказалась крайне высока. Настолько, что начали с ней разбираться. Оказалось что одни пациенты положительно и сильно реагировали на стимуляцию, а другие - слабее и отрицательно. Первая категория лиц и обеспечивала в целом высокий положительный эффект. Т.о. количественный анализ позволил выйти на качественные различия.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Varta
сообщение 11.11.2008 - 13:31
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 20
Регистрация: 29.10.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 5459



Цитата(nokh @ 10.11.2008 - 19:26) *
Но помню анализировал данные по влиянию электростимуляции органов ЖКТ на скорость разрешения послеоперационного пареза. Так там индивидуальная изменчивость оказалась крайне высока. Настолько, что начали с ней разбираться. Оказалось что одни пациенты положительно и сильно реагировали на стимуляцию, а другие - слабее и отрицательно. Первая категория лиц и обеспечивала в целом высокий положительный эффект. Т.о. количественный анализ позволил выйти на качественные различия.

Это на самом деле достаточно важный момент - понять, всем надо назначать лекарство или только части больных. Обычно ставится цель - доказать что лекарство работает у некоего усредненного пациента с какой-либо патологией.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Varta   Несколько биоптатов с крысы - как анализировать?   30.10.2008 - 10:00
- - плав   Цитата(Varta @ 30.10.2008 - 10:00) Д...   30.10.2008 - 11:56
- - DrgLena   А что и как измерили в биоптатах? Если например, ...   30.10.2008 - 12:16
- - Varta   Плав, я поняла вашу точку зрения. Я неполно сформу...   30.10.2008 - 18:17
- - DoctorStat   Наблюдения для одной крысы зависимы, поэтому нельз...   30.10.2008 - 20:02
- - nokh   Дисперсионный анализ с повторными измерениями разр...   30.10.2008 - 20:56
|- - DoctorStat   Цитата(nokh @ 30.10.2008 - 20:56) Ди...   31.10.2008 - 13:11
- - nokh   Цитата(DoctorStat @ 31.10.2008 - 16...   31.10.2008 - 14:27
|- - DoctorStat   Цитата(nokh @ 31.10.2008 - 14:27) По...   31.10.2008 - 15:44
|- - плав   Цитата(DoctorStat @ 31.10.2008 - 15...   31.10.2008 - 17:52
- - Varta   Спасибо за ценную информацию. При пристальном изуч...   3.11.2008 - 08:28
|- - плав   Цитата(Varta @ 3.11.2008 - 08:28) 1)...   3.11.2008 - 12:36
- - Varta   repeated measures ANOVA rat это все-таки анализ по...   3.11.2008 - 14:09
|- - плав   Цитата(Varta @ 3.11.2008 - 14:09) re...   3.11.2008 - 16:51
- - nokh   Выше я неправильно назвал комплекс перекрестно-иер...   3.11.2008 - 18:18
- - плав   А почему не хотите использовать процедуру MIXED? M...   3.11.2008 - 20:36
- - nokh   С mixed я еще не разобрался. Ваш код выдает резуль...   3.11.2008 - 22:06
|- - плав   Цитата(nokh @ 3.11.2008 - 22:06) При...   3.11.2008 - 22:11
- - Varta   Таблица из Статистики 6.0 взяты группа - крыса -...   3.11.2008 - 22:55
- - nokh   >плав. Ясно, значит это терминологические тонко...   4.11.2008 - 00:16
- - Varta   Преобразование ситуацию не спасет, я для того, что...   4.11.2008 - 07:10
- - Varta   плав ЦитатаЕсли бы Вы потрудились посмотреть ссылк...   4.11.2008 - 08:39
|- - плав   Цитата(Varta @ 4.11.2008 - 08:39) пл...   4.11.2008 - 10:27
- - nokh   Вы вступаете в неконструктивную полемику с человек...   4.11.2008 - 09:44
- - Varta   ничего биологически значимого не произошло. В данн...   4.11.2008 - 11:23
- - плав   Мы вообще-то об одном говорим? Цитата из первого п...   4.11.2008 - 18:00
- - Varta   Когда я лет пять назад делала эксперимент в аспира...   6.11.2008 - 05:53
- - nokh   Фактор может быть в анализе фиксированным или случ...   6.11.2008 - 07:47
- - Varta   Фактически я не могу проанализировать данные по по...   7.11.2008 - 17:46
- - nokh   С модулем Repeated Measures не работаю по уже указ...   7.11.2008 - 21:32
- - Varta   Спасибо за объяснения, правда вникаю с трудом пока...   9.11.2008 - 10:23
|- - nokh   Цитата(Varta @ 9.11.2008 - 13:23) ti...   10.11.2008 - 19:26
|- - Varta   Цитата(nokh @ 10.11.2008 - 19:26) Но...   11.11.2008 - 13:31
- - DrgLena   Позволю себе реплику, не по поводу статистических ...   11.11.2008 - 15:34
- - Varta   Цитата(DrgLena @ 11.11.2008 - 15:34)...   12.11.2008 - 14:07


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему