Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Несколько биоптатов с крысы - как анализировать?
Varta
сообщение 30.10.2008 - 10:00
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 20
Регистрация: 29.10.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 5459



Допустим имеем 2 группы по 6 крыс в каждой. У каждой крысы взято по 3 биоптата. Как анализировать?
Вариант 1 расчитать среднее по 3 биоптатам для каждой крысы и сравнить 6 и 6. (скажем, сделать Манна-Уитни)
Вариант 2 сравнить 18 биоптатов одной группы с 18 другой.
Правильно конечно делать первый вариант, поскольку при втором увеличивается вклад индивидуальной вариабельности и мы недооценим риск получить различия обусловленные случайной комбинацией крыс. Но чувствительность в первом варианте достаточно мала а хочется все-таки больше.
Есть какие-нибудь ещё варианты?

Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
DrgLena
сообщение 11.11.2008 - 15:34
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Позволю себе реплику, не по поводу статистических рекомендаций двух специалистов, которые сами по себе являются весьма ценными, для изучающих статистику. Я по поводу примера, по поводу которого дискуссия возникла. Методика планирования, прежде всего, должна быть корректной. Она должна быть над статистикой. Жаль, что нет такой ветки на форуме, где можно было бы получить столь же профессиональные рекомендации, и причем «нашару», то бишь даром.
Если в эксперименте в двух группах по 6 крыс, то размышления о больных явно преждевременны. И интересует, все же активность фермента, а не число нейтрофилов в биоптатах, методика определения которых, весьма приблизительна. Обычно, активность ферментов в тканях определяют очень точными методами (сперктрофотометрическими), готовя при этом стандартные гомогенаты тканей, и выделяя центрифугированием конкретную фракцию, и в ней определяют активность фермента. Мы, правда, ткани исследуем только после вывода животного из эксперимента, не из биоптата, а в динамике - только кровь. Миелопероксидазу мы не определяем, но массу других ферментов делаем, в частности, глутатионпероксидазу в тканях глаза и печени. Может вам стоит подумать, прежде всего, о методиках, а иначе крыс вам понадобится очень много, этический комитет не одобрит. smile.gif
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
Varta
сообщение 12.11.2008 - 14:07
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 20
Регистрация: 29.10.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 5459



Цитата(DrgLena @ 11.11.2008 - 15:34) *
Позволю себе реплику, не по поводу статистических рекомендаций двух специалистов, которые сами по себе являются весьма ценными, для изучающих статистику. Я по поводу примера, по поводу которого дискуссия возникла. Методика планирования, прежде всего, должна быть корректной. Она должна быть над статистикой. Жаль, что нет такой ветки на форуме, где можно было бы получить столь же профессиональные рекомендации, и причем «нашару», то бишь даром.

Позволю себе с вами на 200% согласиться. И даже еще немного расширить тему. Беды наших отечественных научных работ в области медицины связаны даже не с незнанием статистики, а с грубыми ошибками в планировании и протоколе исследования. Я уже молчу про выбор конкретного способа измерения интересующего параметра. Но, извиняюсь, часто вижу работы уже как бы в стадии завершения набора материала и статистической обработки. И только на этой стадии вдруг выясняется что, например, у группы исследования соискатель определил показатель до назначения лечения и после, а у группы сравнения - только до. А зачем после - мы же их не лечили? Или еще какие-нибудь "мелочи", благодаря которым, полученные данные пригодны только для украшения мусорного ведра. Наши аспиранты, например, по моему глубокому убеждению, должны первые месяцы аспирантуры, ДО того как начать набирать материал по своей теме, банально учить матчасть, посещать полный учебный день занятия по предметам study design, RCT, clinical epidemiology, GCP, basic statistic, advanced statistic и т.д. и т.п. и кандидатский минимум сдавать не в объеме философии и английского, а в объеме дисциплин "методология клинического исследования" и "биостатистика"

Сообщение отредактировал Varta - 12.11.2008 - 14:09
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Varta   Несколько биоптатов с крысы - как анализировать?   30.10.2008 - 10:00
- - плав   Цитата(Varta @ 30.10.2008 - 10:00) Д...   30.10.2008 - 11:56
- - DrgLena   А что и как измерили в биоптатах? Если например, ...   30.10.2008 - 12:16
- - Varta   Плав, я поняла вашу точку зрения. Я неполно сформу...   30.10.2008 - 18:17
- - DoctorStat   Наблюдения для одной крысы зависимы, поэтому нельз...   30.10.2008 - 20:02
- - nokh   Дисперсионный анализ с повторными измерениями разр...   30.10.2008 - 20:56
|- - DoctorStat   Цитата(nokh @ 30.10.2008 - 20:56) Ди...   31.10.2008 - 13:11
- - nokh   Цитата(DoctorStat @ 31.10.2008 - 16...   31.10.2008 - 14:27
|- - DoctorStat   Цитата(nokh @ 31.10.2008 - 14:27) По...   31.10.2008 - 15:44
|- - плав   Цитата(DoctorStat @ 31.10.2008 - 15...   31.10.2008 - 17:52
- - Varta   Спасибо за ценную информацию. При пристальном изуч...   3.11.2008 - 08:28
|- - плав   Цитата(Varta @ 3.11.2008 - 08:28) 1)...   3.11.2008 - 12:36
- - Varta   repeated measures ANOVA rat это все-таки анализ по...   3.11.2008 - 14:09
|- - плав   Цитата(Varta @ 3.11.2008 - 14:09) re...   3.11.2008 - 16:51
- - nokh   Выше я неправильно назвал комплекс перекрестно-иер...   3.11.2008 - 18:18
- - плав   А почему не хотите использовать процедуру MIXED? M...   3.11.2008 - 20:36
- - nokh   С mixed я еще не разобрался. Ваш код выдает резуль...   3.11.2008 - 22:06
|- - плав   Цитата(nokh @ 3.11.2008 - 22:06) При...   3.11.2008 - 22:11
- - Varta   Таблица из Статистики 6.0 взяты группа - крыса -...   3.11.2008 - 22:55
- - nokh   >плав. Ясно, значит это терминологические тонко...   4.11.2008 - 00:16
- - Varta   Преобразование ситуацию не спасет, я для того, что...   4.11.2008 - 07:10
- - Varta   плав ЦитатаЕсли бы Вы потрудились посмотреть ссылк...   4.11.2008 - 08:39
|- - плав   Цитата(Varta @ 4.11.2008 - 08:39) пл...   4.11.2008 - 10:27
- - nokh   Вы вступаете в неконструктивную полемику с человек...   4.11.2008 - 09:44
- - Varta   ничего биологически значимого не произошло. В данн...   4.11.2008 - 11:23
- - плав   Мы вообще-то об одном говорим? Цитата из первого п...   4.11.2008 - 18:00
- - Varta   Когда я лет пять назад делала эксперимент в аспира...   6.11.2008 - 05:53
- - nokh   Фактор может быть в анализе фиксированным или случ...   6.11.2008 - 07:47
- - Varta   Фактически я не могу проанализировать данные по по...   7.11.2008 - 17:46
- - nokh   С модулем Repeated Measures не работаю по уже указ...   7.11.2008 - 21:32
- - Varta   Спасибо за объяснения, правда вникаю с трудом пока...   9.11.2008 - 10:23
|- - nokh   Цитата(Varta @ 9.11.2008 - 13:23) ti...   10.11.2008 - 19:26
|- - Varta   Цитата(nokh @ 10.11.2008 - 19:26) Но...   11.11.2008 - 13:31
- - DrgLena   Позволю себе реплику, не по поводу статистических ...   11.11.2008 - 15:34
- - Varta   Цитата(DrgLena @ 11.11.2008 - 15:34)...   12.11.2008 - 14:07


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему