Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
15.12.2008 - 13:41
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 11 Регистрация: 15.12.2008 Пользователь №: 5623 |
Форумчане, еще один « чайник » обращается к вам с призывом о помощи. Проблема следующая:
Облучали клетки крови (лимфоциты) двумя дозами Д1 и Д2 последовательно с интервалом 5-6 часов, после чего просматривали 500-1000 клеток с целью выявления хромосомных аберраций . Аберрантных клеток обнаруживается, как правило, от 3 до 30% в зависимости от величины используемых доз. Число аберрантных клеток на 100 просчитанных (N) подчиняется биномиальному распределению. Эффект 2-х кратного облучения не аддитивный, т.е. N(Д1) + N(Д2) > N (Д1Д2) . Известно как явление адаптации. Надо установить достоверно ли различие. Проблема возникла в связи с тем, что сравнивать надо сумму средних. Буду очень признательна, если кто-то сможет предложить выход из этой ситуации. |
|
|
![]() |
![]() |
![]() |
12.01.2009 - 09:10
Сообщение
#2
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1219 Регистрация: 13.01.2008 Из: Челябинск Пользователь №: 4704 |
На личное сообщение отвечу в форум - может еще кому пригодится.
Использование преобразования Фримана-Тьюки для биномиально распределенных показателей описано в статье: Бобринев Е.В., Ревазова Ю.А. ??? // Генетика. 1985. Т.21, № 1. С. 54-59. Оно рекомендовалось также в МУ: "Статистическая обработка данных тестирования на мутагенность. Методические указания /Лекявичюс Р.К. и др./ - Вильнюс, 1989. - 44 с. Должны быть и более свежие работы (не слежу, от цитогенетики почти отошел). В принципе, и фи-преобразование хорошо работает, но когда частоты очень малы (удобно измерять не в %, а в 0/00) оно недостаточно сильное и ФТ заметно лучше. Неудобство ФТ в том, что для одной и той же частоты при разном количестве проанализированных клеток будут разные значения. Например, если и в опыте и в контроле частота была 1%, но в опыте анализировалось 1000 кл, а в контроле 500 - преобразованные значения будут разными, а различия (которых на самом деле нет) - возможно стат. значимыми. Поэтому его стоит применять когда число анализируемых клеток везде одинако. Про фи-преобразование есть в "Урбах В. Ю. - Биометрические методы: (стат. обработка опыт. данных в биологии, с.-х. и медицине). - М.: Наука, 1964. - 415 с." (переснятая книга недавно появилась в интернете - 80 Мб, не помню откуда качал). Цитата: Мой следующий вопрос: а можно посчитать доверительный интервал по формулам для биномиального распределения (без преобразования данных) и нарисовать их на графике, а выводы о достоверности различий делать на основании преобразованных данных? Это будет зависеть от контекста анализа данных - как я описывал выше. (1) Если вы используете в качестве единицы измерения животное - то среднее вычисляется по частотам для разных животных и соответственно доверительный интервал нужно давать для этого случая - т.е. посчитать среднее и ДИ по фи-преобразованным, а потом пересчитать среднее и границы ДИ в доли или %. Этот ДИ будет асимметричным. (2) Если вы используете в качестве единицы анализа клетку - то следует привести ДИ для биномиального распределения (на этом форуме подробно обсуждались разные формулы для расчета этого ДИ). Но при таком подходе вы суммируете данные по клеткам от разных животных, а это не совсем правильно. В "Руководство по краткосрочным тестам для выявления мутагенных и канцерогенных химических веществ. Женева: ВОЗ, 1989. Т.51. (Гигиенические критерии состояния окр. среды)." рекомендован такой подход: сначала проверить данные по разным животным в экспериментальной группе на однородность (с помощью критериев типа хи-квадрат) и если они однороды - объединять клетки от животных. Если не однородны - не объединять и считать единицей анализа частоту от одного животного. Мне объединение не нравится. Все-таки каждое животное - отдельный цельный оранизм, а не культура клеток, а если экстраполировать результаты на людей- то объединение еще более сомнительно, т.к. популяции человека куда более гетерогенны чем колонии лабораторных животных. Итог. Если будете использовать для сравнения дисперсионный анализ - правильнее приводить ДИ (1). Сообщение отредактировал nokh - 12.01.2009 - 09:27 |
|
|
![]() |
![]() |
jalo Не аддитивный эффект воздействия 15.12.2008 - 13:41
DoctorStat Цитата(jalo @ 15.12.2008 - 13:41) кт... 15.12.2008 - 13:56
jalo Большое спасибо за ответ. Но ситуация такая: Д2-бо... 15.12.2008 - 14:44
DoctorStat Цитата(jalo @ 15.12.2008 - 14:44) Мо... 15.12.2008 - 14:59
jalo Большое спасибо. Все так очевидно. Видимо взгляд ... 15.12.2008 - 15:02
nokh Из вашего описания проблемы пока вообще ничего не ... 15.12.2008 - 16:16
jalo Согласна, вопрос я сформулировала не лучшим образо... 16.12.2008 - 15:57
плав Цитата(jalo @ 16.12.2008 - 15:57) Со... 16.12.2008 - 21:31
jalo В дополнение. Под средним подразумевается число аб... 16.12.2008 - 21:43
nokh На мой взгляд задача не самая простая - информация... 17.12.2008 - 00:31
jalo Спасибо большое. Пока совсем ничего не понятно.
В... 17.12.2008 - 12:17
плав Цитата(nokh @ 12.01.2009 - 09:10) Ци... 12.01.2009 - 11:14
jalo Спасибо за информацию.
Попробую переварить. 13.01.2009 - 10:57![]() ![]() |