Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

> Годовые тренды
Green
сообщение 20.11.2009 - 17:31
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 120
Регистрация: 27.08.2009
Пользователь №: 6284



День добрый!

Есть таблица

Число случаев
Год показательБ1 показательБ2 показательБ3 Всего(сумма Б1+Б2+Б3)
2000
2001
2002
....


на пересечении стоят целые числа - количество случаев, выявленных за год.

Задача, показать, что есть изменения во временном тренде, т.е. с течением времени.
Как вариант - показать, что( к примеру) Б1 растет в удельном количестве по сравнению с Б2, который падает, а Б3 не изменился за эти годы.

Есть мысль насчет регресии, но....по ней вопросы.
Но если у кого есть опыт, как анализировать эти данные - поделитесь, пожалуйста.

Сообщение отредактировал Green - 20.11.2009 - 17:33


Signature
Это не кованализ :)
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
 
Открыть тему
Ответов
DrgLena
сообщение 27.11.2009 - 21:46
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Регрессионные модели для А я сделала и линейную и Пуассона, могу выложить, сравнить оценки, остатки т.т.д. Но не совсем понятно, как с трендом по Neumann.
Для А=средний квадрат (n-1) последовательных разностей =((66-60)^2+(60-64)^2+(64-33)^2+(33-53)^2+(53-38)^2)/5=327,6
Дисперсия=192,3
Отношение =1,7 в таблице критич. знач для n=6 и 5% уровня 0,89 и нулевая гипотеза не отклоняется.
Для болезни Б отношение =192/241=0,82 что ниже критического и принимается гипотеза о наличие тренда. Green, что у меня не так?
Не понятна для меня идея DoctorStat относительно использования LR для этих данных, поскольку оценить вероятность получить заболевание можно только если есть альтернатива ( не заболел), а в этих данных все больные.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
nokh
сообщение 27.11.2009 - 23:03
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1219
Регистрация: 13.01.2008
Из: Челябинск
Пользователь №: 4704



Цитата(DrgLena @ 28.11.2009 - 00:46) *
Регрессионные модели для А я сделала и линейную и Пуассона, могу выложить, сравнить оценки, остатки т.т.д.

Тоже сделал, только что. Описанные выше преимущества корреляции Спирмена для этих данных не работают, т.к. тренды не монотонные и корреляция не равна 1. Пуассоновская регрессия оказалась примитивной - та же линейная OLS, только зависимая переменная предварительно логарифмируется через ln. Пока разбирался нашёл хорошую бесплатную программу, в которой в результате всё и обсчитал. Через х обозначил количество больных заболеванием A, В или С, через АВС их сумму, через у - долю больных (в %) заболеванием A, В или С. Итак для данных Green имеем:
1). Общее количество больных не изменялось статистически значимо за период 2003-2008 гг.
Пуассоновская регрессия ln(ABC)=10,619138-0,002978*Year; Р=0,944.
2). Для всех трёх заболеваний тренды изменения доли больных хорошо описывались обычной пуассоновской регрессией без выраженных изломов. Необходимость разбиения тренда на 2 части для заболеваний А, В и С была незначима (соответственно: Р=0,154, Р=0,588 и Р=0,987).
3). Заболевание А. Пуассоновская регрессия с учётом общего количества больных: ln(у)=202,645592-0,095643*Year. Снижение, тренд статистически значим: Р=0,025446. Среднегодовое процентное изменение (Average Annual Percent Change - AAPC) = -9,1 (95%ДИ: -13,9; -4,1).
4). Заболевание B. Пуассоновская регрессия с учётом общего количества больных: ln(у)=-393,500771+0,201350*Year. Рост, тренд статистически значим: Р=0,019299. AAPC=22,3 (95%ДИ: 10,2; 35,7).
5). Заболевание C. Пуассоновская регрессия с учётом общего количества больных: ln(у)=185,996767-0,087859*Year. Снижение, тренд статистически незначим: Р=0,29222. AAPC = -8,4 (95%ДИ: -20,5; 5,6).
6). Таким образом, наблюдаемые изменения в структуре заболеваемости ABC связаны со снижением доли больных заболеванием А и ростом доли больных B, причём темпы роста доли В в 2,5 раза превышают темпы снижения доли А: величины среднегодового процентного изменения составили соответственно 22,3 (95%ДИ: 10,2; 35,7) и -9,1 (95%ДИ: -13,9; -4,1).

Программу можно скачать здесь: http://srab.cancer.gov/joinpoint/download.html , а почитать про подход с кусочными регрессиями и расчётом по ним AAPC здесь: http://srab.cancer.gov/joinpoint/aapc.html .Преимущество этой программ по сравнению с обычным в эпидемиологии использованием пуассоновской регрессии - возможность учёта размера выборки (колонка Population) при оценках пуассоновской регрессии, т.е. по сути взвешивание каждого наблюдения, а также возможность анализа сложных трендов с изломами и статистическая оценка необходимости введения в модель таких изломов.
Цитата(DrgLena @ 28.11.2009 - 00:46) *
Но не совсем понятно, как с трендом по Neumann...

Этот анализ не делал, но подозреваю в чём причина. Тренды становятся заметными и статистически значимыми при переходе от абсолютных частот к относительным. Предоставленные Green цифры нужно предварительно перевести в доли от общего числа заболеваний (раз речь идёт о структуре), а затем преобразовать через натуральный логарифм или лучше через угловые преобразования для долей (например, фи-преобразование у=2*arcsin SQRT(p), где р-доля в долях единицы).

Вроде разобрались. Удивительно сколько цифр можно получить из исходных 18 smile.gif

Сообщение отредактировал nokh - 27.11.2009 - 23:32
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
Прикрепленное изображение
 
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Сообщений в этой теме
- Green   Годовые тренды   20.11.2009 - 17:31
- - nokh   DoctorStat не так давно выкладывал очень хорошую к...   20.11.2009 - 19:22
- - Green   nokh, Во-первых, спасибо за оперативность. Во-вто...   20.11.2009 - 23:34
|- - DoctorStat   Цитата(Green @ 20.11.2009 - 23:34) К...   21.11.2009 - 11:02
|- - nokh   Цитата(Green @ 21.11.2009 - 02:34) ....   23.11.2009 - 07:18
- - Green   DoctorStat, спасибо. Именно так и думала сделать...   21.11.2009 - 18:21
- - DrgLena   А можно ли подробнее, в каких статистических пакет...   21.11.2009 - 22:26
- - Green   DrgLena, Речь шла не о Нойманне ("Доверитель...   22.11.2009 - 10:33
- - DrgLena   Критерий Нойманна для тренда из Закса. Я про него,...   22.11.2009 - 12:59
- - Green   nokh, спасибо еще раз! 1. Еще раз напишу пост...   23.11.2009 - 19:46
|- - DoctorStat   Цитата(Green @ 23.11.2009 - 19:46) З...   23.11.2009 - 22:25
|- - nokh   Цитата(Green @ 23.11.2009 - 22:46) Е...   25.11.2009 - 07:08
- - DrgLena   Green, желательно привести реальные данные, тогда ...   24.11.2009 - 01:35
- - Green   Спасибо DrgLena за все комментарии 1. Фон Нейман ...   24.11.2009 - 14:05
- - DrgLena   Вы хотите грамотно посчитать и оформить результат....   24.11.2009 - 21:39
- - Green   > Вы многократно повторяете, что у вас есть на ...   25.11.2009 - 00:00
- - DrgLena   Новый поворот мысли, относительные риск посчитать....   25.11.2009 - 00:50
- - Green   Что значит писать поздно вечером:) 1.В предыдущем...   25.11.2009 - 02:45
|- - DoctorStat   Цитата(Green @ 25.11.2009 - 02:45) Я...   25.11.2009 - 11:41
|- - nokh   Цитата(DoctorStat @ 25.11.2009 - 14...   25.11.2009 - 11:53
|- - DoctorStat   Цитата(nokh @ 25.11.2009 - 11:53) Ши...   25.11.2009 - 14:51
|- - nokh   Спасибо, Кендалл и Стюарт есть, читал/листал когда...   25.11.2009 - 15:50
- - DrgLena   Уважаемые коллеги-волонтеры (злопыхателей нет), по...   25.11.2009 - 12:23
- - DrgLena   Цитата(Green @ 25.11.2009 - 03:45) 3...   25.11.2009 - 12:55
- - Green   nokh, спасибо! Ткнули в нос. Эта работа свалил...   25.11.2009 - 16:07
- - DrgLena   Конечно, ехать, снимается не корректно употребленн...   25.11.2009 - 18:39
- - nokh   ОК, но быстро не сделаю: хочу попробовать ещё пуас...   25.11.2009 - 21:48
- - DrgLena   Регрессионные модели для А я сделала и линейную и...   27.11.2009 - 21:46
|- - DoctorStat   Цитата(DrgLena @ 27.11.2009 - 21:46)...   27.11.2009 - 22:25
|- - nokh   Цитата(DrgLena @ 28.11.2009 - 00:46)...   27.11.2009 - 23:03
- - DrgLena   Меня, все же, интересует прогноз, поэтому регресси...   27.11.2009 - 22:17
- - nokh   Цитата(DrgLena @ 28.11.2009 - 01:17)...   27.11.2009 - 23:10
- - DrgLena   Пуассонову регрессию я провела в двух программах и...   28.11.2009 - 00:03
- - nokh   Коэффициенты потому и отличаются, что я анализиров...   28.11.2009 - 00:27
- - DrgLena   Nokh, спасибо, стало понятней, но все же, на бытов...   28.11.2009 - 00:44
- - nokh   Так Вы - врач, я - эколог, откуда браться арифмети...   28.11.2009 - 01:06
- - DrgLena   Это среди математиков, я врач, а среди врачей - ма...   28.11.2009 - 01:24
- - Green   nokh, LrgLena, DoctorStat - всем спасибо! nok...   30.11.2009 - 12:10
- - Green   DrgLena, число событий в единицу времени (Пуассон...   30.11.2009 - 13:01
- - Green   nokh, 1. почему вы считали доли для JP? Что страшн...   30.11.2009 - 14:13
|- - nokh   Цитата(Green @ 30.11.2009 - 14:10) В...   30.11.2009 - 17:28
- - Green   nokh, в пакете JP я выставила модель "using ...   30.11.2009 - 17:57
- - Green   nokh, я еще поспрашиваю. В дополнение к предыдуще...   1.12.2009 - 21:20
|- - nokh   Цитата(Green @ 1.12.2009 - 23:20) .....   2.12.2009 - 18:43
- - Green   понятно, спасибо! поскольку занималась анализ...   2.12.2009 - 21:47
- - Игорь   Почему для решения задачи выделения годового тренд...   3.12.2009 - 08:31
- - Green   Только мое мнение: ССА требует значительно больше...   3.12.2009 - 17:28
- - Green   Игорь, я еще добавлю рассуждение такого плана: При...   4.12.2009 - 10:24


Добавить ответ в эту темуОткрыть тему