Форум врачей-аспирантов

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

 
Добавить ответ в эту темуОткрыть тему
> Не знаю с чего начать
genbytu
сообщение 16.11.2011 - 18:02
Сообщение #1





Группа: Пользователи
Сообщений: 5
Регистрация: 2.09.2009
Пользователь №: 6305



Уважаемые коллеги, изучение статистики только начал, поэтому извиняюсь за глупый вопрос.
Есть 2 группы пациентов. Первая группа 49 пациентов получающих внутриартериальную химиотерапию, вторая 68 пациентов получающих системную химиотерапию. Оценка эффективности химиотерапии по шкале RECIST:
Полный ответ
Частичный ответ
Стабилизация
Прогрессирование

Частичный ответ получили у 22 пациентов первой группы и у 18 пациентов 2-й группы, стабилизацию у 17 и 19 соответственно и т.д. Как мне посчитать достоверность с учетом количества наблюдений?
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
p2004r
сообщение 16.11.2011 - 21:44
Сообщение #2





Группа: Пользователи
Сообщений: 1091
Регистрация: 26.08.2010
Пользователь №: 22699



Цитата(genbytu @ 16.11.2011 - 17:02) *
Уважаемые коллеги, изучение статистики только начал, поэтому извиняюсь за глупый вопрос.
Есть 2 группы пациентов. Первая группа 49 пациентов получающих внутриартериальную химиотерапию, вторая 68 пациентов получающих системную химиотерапию. Оценка эффективности химиотерапии по шкале RECIST:
Полный ответ
Частичный ответ
Стабилизация
Прогрессирование

Частичный ответ получили у 22 пациентов первой группы и у 18 пациентов 2-й группы, стабилизацию у 17 и 19 соответственно и т.д. Как мне посчитать достоверность с учетом количества наблюдений?


в рамках шутки и разминки можно например бутстрепом smile.gif

докажем насколько случайно 22 "частичный ответ" в первой группе

делаем общую группу 49+68 случаев из них 22+18 дали "частичный ответ"
Код
> c(c(rep(1,22),rep(0,49-22)), c(rep(1,18),rep(0,68-18)))
  [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
[38] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0
[75] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
[112] 0 0 0 0 0 0
> level2 <- c(c(rep(1,22),rep(0,49-22)), c(rep(1,18),rep(0,68-18)))


делаем из такой общей группы случайную выборку размером в группу где было 22 значения "частичный", вот несколько таких выборок

Код
> sample(level2, 49, replace = FALSE)
[1] 0 1 0 1 1 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0
[39] 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1
> sample(level2, 49, replace = FALSE)
[1] 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0
[39] 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0
> sample(level2, 49, replace = FALSE)
[1] 1 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0
[39] 0 0 1 0 1 0 0 1 1 0 1


подсчитываем сколько из них оказались "частичный ответ"
Код
> sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))
[1] 10
> sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))
[1] 17
> sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))
[1] 15
> sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))
[1] 17
> sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))
[1] 17


теперь посмотрим сколько выпадает случаев "частичный ответ" в 10 попытках

Код
> replicate(10,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))
[1] 17 18 19 21 15 13 18 17 16 20
> replicate(10,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))
[1] 14 13 20 14 16 16 15 16 19 20
> replicate(10,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))
[1] 19 19 16 18 15 19 20 17 18 19


построим гистограмму для 100000 попыток

Код
> hist(replicate(100000,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE))))


результат в первом присоединенном рисунке

теперь посчитаем какая доля значений равна или больше полученного в эксперименте значения 22

фактически это вероятность ошибки (для одностороннего критерия)

Код
> sum(replicate(100000,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))>=22)/100000
[1] 0.03056
> sum(replicate(100000,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))>=22)/100000
[1] 0.02906
> sum(replicate(100000,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))>=22)/100000
[1] 0.03029


ну и теперь построим гистограмму для 100 таких измерений и узнаем интервальную оценку вероятности ошибки для одностороннего критерия


Код
> hist(replicate(100,sum(replicate(100000,sum(sample(level2, 49, replace = FALSE)))>=22)/100000))


Сообщение отредактировал p2004r - 16.11.2011 - 22:17
Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
Прикрепленное изображение
 


Signature
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
DrgLena
сообщение 16.11.2011 - 22:12
Сообщение #3





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Цитата(genbytu @ 16.11.2011 - 19:02) *
Частичный ответ получили у 22 пациентов первой группы и у 18 пациентов 2-й группы, стабилизацию у 17 и 19 соответственно и т.д.

Заполните еще две категории ответа первую и четвертую, чтобы сравнить эффективность лечения в таблицах сопряженности с упорядоченными категориями.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
vra4-aspirant
сообщение 17.12.2011 - 19:12
Сообщение #4





Группа: Пользователи
Сообщений: 5
Регистрация: 22.07.2010
Пользователь №: 22619



Здравствуйте!Помогите пожалуйста разобратся.Я исследую 4 группы женщин с различным весом:1 группа-60 женщин, 2-группа-30 женщин, 3-группа-30 женщин, 4группа-60 женщин.Получила результаты исследования, теперь не могу понять, как посчитать p?Стоит ли, его считать или можно взять дгругой критерий?Насколько все это будет правильно?Пользуюсь STATISTICA 17.0.Добрые люди напугали, сказав что, результаты будут неверны, т.к. численность в группах разная(((Подскажите pleaseeeee.
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 
DrgLena
сообщение 17.12.2011 - 19:42
Сообщение #5





Группа: Пользователи
Сообщений: 1325
Регистрация: 27.11.2007
Пользователь №: 4573



Цитата(vra4-aspirant @ 17.12.2011 - 19:12) *
Получила результаты исследования, теперь не могу понять, как посчитать p?Стоит ли, его считать или можно взять дгругой критерий?Насколько все это будет правильно?Пользуюсь STATISTICA 17.0

А по вашему р - это критерий? Лучше вообще ничего не считайте, особенно STATISTICA 17.0
Вернуться в начало страницы
 
+Ответить с цитированием данного сообщения
 

Добавить ответ в эту темуОткрыть тему