 Диагностическая значимость маркера: расчет специфичности и чувствительности, площадь под кривой и прочее |
Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
 20.12.2011 - 11:24
Сообщение
#1
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 11 Регистрация: 20.12.2011 Пользователь №: 23374  |
Доброго дня!
Объясните, пошагово, как рассчитать диагностическую значимость протеина (скажем, А) для диагностики заболевания. С определением cut-off на разных уровнях. Исходные данные: наличие 2-х групп обследованных (с патологией, и группы сравнения). В группах определен белок А. Есть различия среднего сожержания белка А (и Ме, понятно). Тем не менее, важен качественный анализ. Если я правильно понимаю, то для расчета чувствительности-специфичности необходимо пользоваться определением площади под кривой. Какие значения чувствительности-специфичности (%) определяют диагностическую значимость маркера? ( возможность его использования в качестве диагностического маркера) СПАСИБО! |
 |
 
|
 |
|
 |
Ответов
(1 - 4)
|
20.12.2011 - 11:30
Сообщение
#2
|
|
 Группа: Пользователи Сообщений: 1091 Регистрация: 26.08.2010 Пользователь №: 22699 |
Цитата(Па адокс @ 20.12.2011 - 11:24)  Если я правильно понимаю, то для расчета чувствительности-специфичности необходимо пользоваться определением площади под кривой. как бы в википедии все есть http://en.wikipedia.org/wiki/Receiver_oper..._characteristic вот пакет для анализа ROC в R http://web.expasy.org/pROC/  |
|
|
|
|
|
|
20.12.2011 - 11:32
Сообщение
#3
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 11 Регистрация: 20.12.2011 Пользователь №: 23374 |
Спасибо за оперативность.
Ход мыслей - взять для анализа чув-ти и специфичности площадь под кривой - верный? |
|
|
|
|
|
|
20.12.2011 - 13:13
Сообщение
#4
|
|
|
Группа: Пользователи Сообщений: 1325 Регистрация: 27.11.2007 Пользователь №: 4573 |
Цитата(Па адокс @ 20.12.2011 - 11:32) Ход мыслей - взять для анализа чув-ти и специфичности площадь под кривой - верный? Нет, не верно. Чув-ть и спец. зависят от конкретной точки разделения, а площадь не зависит от выбранной точки. Читайте |
|
|
|
|
|
|
20.12.2011 - 17:17
Сообщение
#5
|
|
 Группа: Пользователи Сообщений: 1162 Регистрация: 10.04.2007 Пользователь №: 4040 |
Цитата(Па адокс @ 20.12.2011 - 12:24) Доброго дня! Объясните, пошагово, как рассчитать диагностическую значимость протеина (скажем, А) для диагностики заболевания. С определением cut-off на разных уровнях. Исходные данные: наличие 2-х групп обследованных (с патологией, и группы сравнения). В группах определен белок А. Есть различия среднего сожержания белка А (и Ме, понятно). Тем не менее, важен качественный анализ. Если я правильно понимаю, то для расчета чувствительности-специфичности необходимо пользоваться определением площади под кривой. Какие значения чувствительности-специфичности (%) определяют диагностическую значимость маркера? ( возможность его использования в качестве диагностического маркера) СПАСИБО! По моему мнению, Ваши данные совершенно четко ложатся на методику ROC анализа, выполненную в модуле "Непараметрическая статистка" программного обеспечения AtteStat. Добавлю, что данный метод в упомянутой программе был реализован в том числе и в результате обсуждения на настоящем форуме с помощью уважаемых коллег. Сообщение отредактировал Игорь - 20.12.2011 - 17:18 Ebsignasnan prei wissant Deiws ainat! As gijwans! Sta ast stas arwis!
|
|
|
|
|
|
 |