С камерой не работал, сталкивался только с морфометрией фотоматериалов и сканированных листочков растений. Есть небольшая бесплатная - UTHSCSA ImageTool, не фонтан по удобству, но работать можно:
http://ddsdx.uthscsa.edu/dig/itdesc.html (дипломники работали

). Измеряет углы, расстояния, площади. Есть какие-то фильтры, возможно нужные для анализа именно медицинских фото, т.к. созавалась медиками. Более широко известна Scion Image, проект существует очень давно. Тоже бесплатна, но требуется регистрация:
http://www.scioncorp.com/pages/scion_image_windows.htm. Не знаю работают ли они с камерой. Насколько помню неплохая платная программка - Bersoft Image Measurement. Ведет протокол измерений. Пишут, что может измерять изображения from TWAIN scanners and digital cameras or from live video sources:
http://bersoft.com/bimagem/index.htmЧтобы сообщение не было офтопом в этом форуме сообщу также, что в сети можно найти книги по статистическому анализу морофометрических данных:
- Lele S.R & Richtsmeier J.T. (2001) An Invariant Approach to Statistical Analysis of Shapes. Chapman &. Hall/CRC. 308 p. (встречается в виде 4,8 Мб rar-архива pdf-документов).
- Geometric Morphometrics for Biologists : A Primer. (Hard cover book) ISBN:9780127784601
Zelditch, Miriam Leah /Swiderski, Donald L. /Sheets, David H. /Fink, W /Publisher:Academic Pr Published 2004/07 (14 Mб rar-архива pdf-документов)