Подскажите, пожалуйста, я врач-гастроэнтеролог. Могу ли я сдать кандидатский минимум по философии и немецкому языку не в медицинском ВУЗе, а в химико-технологическом?

В любом, но:
- по языку - по своей аспирантской специальности
- по истории и философии науки - по группе специальностей, включающей Вашу аспирантскую.

В любом, но:
- по языку - по своей аспирантской специальности
- по истории и философии науки - по группе специальностей, включающей Вашу аспирантскую.



А что это значит?

Что "это"? Уточните вопрос.

Что значит - по своей аспирантской специальности? Специальность у меня - гастроэнтерология.

Вы будете на экзамене переводить англоязычные (немецкие) научные статьи по гастроэнтерологии. Возможно Вам предложат заранее принести несколько таких статей пару из которых впоследствии и дадут Вам на экзамене. А что касается философии науки то это будет просто философия медицинской науки, здесь Ваша медицинская специальность не будет иметь значения.
По крайней мере такая процедура в моем ВУЗе.

Можно сдавать влюбом ВУЗе, где имеется факультет медицинского профиля.

Не совсем так. Каждая специальность имеет свой шифр (код) в соответствии с номенклатурой специальностей научных работников. Важно, чтобы экзамен сдавался именно по той специальности (формальный признак - шифр), по которой автор вопроса учится в аспирантуре ИЛИ собирается защищать диссертацию.