Всем доброго дня!

При написании главы материалы и методы задумался: у меня было исследование на лабораторных животных, которых (включая группу контроля - леченных традиционными методами) можно разделить на пять групп.

Исследование проводилось довольно долго и получилось так, что группа контроля была единой для всего эксперимента.

Вопрос: могу ли я при описании материалов и методов писать, что было две серии экспериментов, в одной исследовалось действие аппарата А, а во второй действие препарата Б, а группа контроля для обеих серий была общей?

Заранее спасибо!

Нет. У Вас была одна группа контроля и один эксперимент. Обрабатывать данные Вы должны так, как обрабатываются эксперименты с несколькими группами сравнения (если показатель количественный, то ДА).

то есть, если я правильно понял в описании исследования нужно писать группа ?1...?4 и группа контроля. Написать что были две серии, в первую из которых вошли группа ?1 и ?2, а во вторую группа ?3 и ?4, и сравнивались они с единой контрольной группой нельзя. То есть в каждой серии должна быть своя контрольная группа?

А как же тогда анализируют данные взятые из архива, которые берутся за группу контроля (к примеру, когда анализируют эффективность какого-то метода в сравнении с предыдущими(традиционными). Может я неправильно называю группой контроля то с чем сравнивают?

Группа контроля есть группа контроля - та, у которой нет изучаемого воздействия. Как она была получена - другой вопрос. Есть конкурентный контроль (одновременно) и исторический (раньше). По доказательности исследования с историческим контролем являются значительно менее доказательными (если не написать бросовыми).
Вы же пытаетесь "удвоить" группу контроля. У Вас не было двух серий (по крайней мере по описанию). Было пять групп - две первой серии, две второй серии и контрольная. При таком описании Вы имеете скоррелированные наблюдения внутри серии, поэтому при анализе необходимо будет учитывать корреляцию групп 1 и 2, 3 и 4. Соответственно, модель будет смешанная с тремя подгруппами для случайного фактора и фиксированным фактором с пятью подгруппами.
Это если у Вам действительно были серии.

Да.... а очень много проводится работ именно с историческим контролем, по крайней мере в травме и ортопедии.

А что значит учитывать корреляцию групп? В смысле какие методы применить для анализа результатов. Клинически я оценивал следующие параметры: срок полного заживления, число гнойных осложнений.

ууппс...посчитал количество животных в контрольных группах, получилось как раз на две серии по количеству.

Начну с конца - для срока полного заживления - анализ выживаемости, для числа гнойных осложнений - регрессия по Пуассону.
Теперь немного сложнее. Если у Вас есть серии, т.е. животные 1 и 2 групп больше похожи друг на друга, чем 3 и 4, это означает, что Вам надо использовать т.н. смешанные модели. Здесь на форуме было достаточно детальное обсуждение этих моделей. Если кратко - то это специальные варианты обычного анализа, но добавляется дополнительный фактор - фактор случайных эффектов. Этот фактор соответствует сериям, т.е. данные организованы так:
Y Group Series
10 1 1
11 2 1
13 3 2
Вот переменная Series и используется как случайный фактор, а Group - как фиксированный - основная идея здесь, что влияние фикисированного фактора Вас интересует, а случайного - не очень, но случайный фактор влияет на разброс данных (дисперсию).

Если же Вы по сериями понимаете что-то другое (например время проведения эксперимента и нет опасений, что время значительно влияло на исход), то от смешанной модели можно отказаться и использовать простые модели, как указано выше.