Уважаемые коллеги, подскажите. Количественные данные, группы зависимые, сравнений больше двух, при использовании ANOVA повторных измерений или критерия Фридмана,а так же критерия Ньюмена-Кейлса (параметрического или непараметрического), выпадение данных нужно учитывать? Т.е. изучаются 10 объектов. Первая серия до лечения (1,2,3,4,..10), вторая серия те же 10 (1,2,3,...10), но после лечения, затем часть из них выводится из эксперимента, для третьей серии остается уже только 5. Был бы очень признателен за помощь.

У вас и так очень мало наблюдений. Единственное оправдание - заболевание является очень редким.
Для критериев , перечисленных Вами, можно пытаться определить их мощность.
Если она очень маленькая (много меньше 0,8), то исследование ничего не стоит.
/В этом случае велика вероятность не обнаружить различия , т. е. совершить ошибку II рода/.

В рамках общих линейных моделей можно обсчитать такой комплекс целиком, но я такие не считал. В R точно можно, главное правильно задать. Намного проще разбить задачу на 2: сравнить первую серию со второй по 10 наблюдениям (парные t-критерий или Вилкоксон), а вторую с с третьей - по 5 этими же критериями. Здесь будет уместна поправка Бонферрони.

Спасибо.