Помощь - Поиск - Пользователи - Календарь
Полная версия этой страницы: Сравнение трех групп по качественному признаку
Форум врачей-аспирантов > Разделы форума > Медицинская статистика
Doktor.86
Всем добрый день!

Прошу помочь решить проблему с сравнением 3х групп по качественному признаку, а именно:

1 группа 28 человек - 5 рецидивов.
2 группа 25 человек - 2 рецидива.
3 группа 38 человек - 0 рецидивов.

Пытался использовать точный критерий Фишера для таблицы 2хN программа DoctorStat, однако возникают мысли, а точно ли она правильно работает?
По всему инету не нашел информации, как сравнить 3 группы по качественному признаку (либо ничего не понял), у Ребровой только минимум информации, у Гланца найти так же ничего нужного не смог...

Подскажите хотя бы какие критерии, параметры и пр. можно использовать для данной проблемы...

Заранее всем благодарен!
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 12.11.2014 - 10:43) *
Подскажите хотя бы какие критерии, параметры и пр. можно использовать для данной проблемы
Вы абсолютно правильно выбрали точный критерий Фишера для сравнения 3-х групп по качественному признаку. Приближенный критерий хи-квадрат в вашем случае нельзя использовать из-за 0 (отсутствия рецидивов) в третьей группе. Правильность результатов работы программы DoctorStat можно проверить с помощью других известных статистических программ, в которых реализован точный критерий Фишера, например в программе SPSS.


Doktor.86
Я очень рад, что вашу программу можно проверить, подскажите как ее можно проверить в статистике и на этом вопрос будет исчерпан, а я буду счастлив и советовать ее всем!!!

Данные для таблиц 2х2 я проверил с помощью ФишерЭкзакт тест индийского происхождения, а вот для таблицы 2хN или хотябы 2х3 найти никак не могу ни в книжках ни где-либо еще!!!
Doktor.86
И в качестве уточнения хотел спросить, возможно ли проводить дисперсионный анализ количественных признаков по группам без нормального распределения?

У Гланца дисперсионный анализ применяется в таких случаях (в примерах и задачах для самостоятельного решения), а позже рассматривая критерий Крускала он пишет, что дисперсионный можно применять только при нормальном распределении, как его можно понять?
Doktor.86
DoktorStat ответь) прошу!!!

Кстати, а хи-квадрат разве можно применять для таблиц больше чем 2х2?
Doktor.86
Извини за ошибку DoctorStat, привычка)))
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 12.11.2014 - 11:08) *
Я очень рад, что вашу программу можно проверить, подскажите как
В программе StatSoft (Statistica) реализации точного критерия Фишера размерности RxC может не быть (по крайней мере я не нашел описания в электронном учебнике на их сайте). В программе SPSS этот критерий точно есть, и в интернете подробно разжевывается, как его применить. On-line калькуляторы (размерности больше чем 2х2) часто врут, поэтому ими лучше не пользоваться. В интернете также есть исходный код на фортране (алгоритм 643). Если у вас есть компилятор Фортрана, то вы можете попытаться откомпилировать этот код и запустить консольную программу.
Хи-квадрат можно использовать для таблиц сопряженности RxC, но есть ограничения: не должно быть много малых чисел (нулей). Кстати, критерий хи-квадрат RxC есть в программе DoctorStat.
Doktor.86
Спасибо DoctorStat за ответ, посмотрю SPSS очень надеюсь на одинаковые результаты с Вашей программой (она восхитительна, при условии, что точна))

Если есть возможность и желание ответьте по поводу дисперсионного анализа, можно ли его применять при неравномернораспределенной выборки?
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 12.11.2014 - 12:07) *
Если есть возможность и желание ответьте по поводу дисперсионного анализа, можно ли его применять при неравномернораспределенной выборки?
Мои знания дисперсионного анализа не превосходят ваших. Конечно, я желал бы стать всемогущим Хоттабычем, вырвать волос из бороды, сказать: "трах, тибидох, тох-тох, ответ на любой вопрос появись". Но это только сказка, действительность интереснее и сложнее.
Doktor.86
Очень жаль, что Вы не Хоттабыч))

И напоследок, DoctorStst, не скинете ссылку на инструкцию SPSS, где расписано про таблицы больше чем 2х2,

Буду премного Вам благодарен!
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 12.11.2014 - 12:24) *
И напоследок, DoctorStst, не скинете ссылку на инструкцию SPSS, где расписано про таблицы больше чем 2х2
Вы мне напомнили песню, в которой есть такие слова ?А напоследок я скажу...?. В приложенном файле есть описание точных статистических методов, реализованных в SPSS. Посмотрите в него, поищите другие руководства в интернете. Кто ищет, тот найдет smile.gif
Doktor.86
Ну DoctorStat, что я могу сказать, позвонил в SPSS и там мне совершенно ничего не сказали, а точнее сказали что проведите данный анализ при помощи дисперсионного, примерно через недели 2, а точный критерий Фишера для трех групп они не делают...
Я им благодарен, но результат...
Так что я стал немного переживать, а точно можно проводить анализ 3 гупп при помощи точного критерия Фишера (хотя в википедии написано что можно)
anserovtv
Точный критерий Фишера для таблиц произвольной размерности представлен в последних версиях SPSS. я недавно использовал.
Также представлен и точный критерий хи-квадрат.
Но информация в руководстве пользователя достаточно противоречива.
Вопрос об условиях применения дисперсионного анализа на данном форуме обсуждался совсем недавно. Советую использовать пакет PAST.
100$
Цитата(Doktor.86 @ 26.11.2014 - 22:26) *
Ну DoctorStat, что я могу сказать, позвонил в SPSS и там мне совершенно ничего не сказали, а точнее сказали что проведите данный анализ при помощи дисперсионного, примерно через недели 2, а точный критерий Фишера для трех групп они не делают...
Я им благодарен, но результат...
Так что я стал немного переживать, а точно можно проводить анализ 3 гупп при помощи точного критерия Фишера (хотя в википедии написано что можно)


Нет, ну совсем молодежь обленилась. Ничего сами не хотят делать. Все только вынь, да положь. Хушь плачь.
Вот как делается Fisher's exact test для таблицы сопряженности произвольной размерности: Ссылка
Все это легко считается в Экселе. Не переворачивая вверх дном Тырнет в поисках халявы.
Держите нас в курсе своих успехов.
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 26.11.2014 - 21:26) *
Ну DoctorStat, что я могу сказать, позвонил в SPSS и там мне совершенно ничего не сказали,... а точный критерий Фишера для трех групп они не делают...
У меня есть только один бог, и этот бог не SPSS и Википедия, а Гланц "Мед-био статистика, 1998". На стр.145 своей книги, в разделе "критерий хи-квадрат для произвольной таблицы сопряженности" он рассматривает три группы женщин по поводу менструаций. Эта таблица 5.5 хорошо заполнена - все числа (и реальные, и ожидаемые больше 5), поэтому товарищ Гланц анализирует ее приближенным методом хи-квадрат. Если бы в этой таблице были маленькие числа (<5), то метод хи-квадрат был бы неприменим, и оставалась бы только одна возможность - использовать точные методы (Фишера).
Цитата(Doktor.86 @ 26.11.2014 - 21:26) *
...а точнее сказали что проведите данный анализ при помощи дисперсионного
Дисперсионный анализ, если мне не изменяет память, делают для количественных данных, например: рост или вес, причем нормально распределенных и с одинаковой дисперсией. Ваши данные - количество рецидивов чисто качественные, поэтому дисперсионный анализ для них неприменим.
Doktor.86
Цитата(anserovtv @ 26.11.2014 - 23:15) *
Точный критерий Фишера для таблиц произвольной размерности представлен в последних версиях SPSS. я недавно использовал.
Также представлен и точный критерий хи-квадрат.
Но информация в руководстве пользователя достаточно противоречива.
Вопрос об условиях применения дисперсионного анализа на данном форуме обсуждался совсем недавно. Советую использовать пакет PAST.


Я разговаривал с инженером официального представителя SPSS в России и говорил ему про точный критерий Фишера и про "мжно-ли сделать для таблицы больше чем 2х2 в SPSS" он сказал, что такого сделать нельзя, я не исключаю, что он ошибся, но все-таки...
Doktor.86
Цитата(100$ @ 27.11.2014 - 01:03) *
Нет, ну совсем молодежь обленилась. Ничего сами не хотят делать. Все только вынь, да положь. Хушь плачь.
Вот как делается Fisher's exact test для таблицы сопряженности произвольной размерности: Ссылка
Все это легко считается в Экселе. Не переворачивая вверх дном Тырнет в поисках халявы.
Держите нас в курсе своих успехов.


Спасибо большое за ссылку, я на нее натыкался в своих поисках, но думал, что эксель не посчитает такие большие цифры (91), ан нет посчитал))))
теперь я могу достоверно все сделать и попробовать проверить DoktorStat, на будущее)))
Doktor.86
Цитата(DoctorStat @ 27.11.2014 - 11:44) *
У меня есть только один бог, и этот бог не SPSS и Википедия, а Гланц "Мед-био статистика, 1998". На стр.145 своей книги, в разделе "критерий хи-квадрат для произвольной таблицы сопряженности" он рассматривает три группы женщин по поводу менструаций. Эта таблица 5.5 хорошо заполнена - все числа (и реальные, и ожидаемые больше 5), поэтому товарищ Гланц анализирует ее приближенным методом хи-квадрат. Если бы в этой таблице были маленькие числа (<5), то метод хи-квадрат был бы неприменим, и оставалась бы только одна возможность - использовать точные методы (Фишера).
Дисперсионный анализ, если мне не изменяет память, делают для количественных данных, например: рост или вес, причем нормально распределенных и с одинаковой дисперсией. Ваши данные - количество рецидивов чисто качественные, поэтому дисперсионный анализ для них неприменим.


Спасибо за помощь, спасибо за программу, я по Гланцу читал статистику, другие полный мрак))) и я понимаю, что хи квадрат можно использовать для таблиц больших чем 2х2, но про точный критерий Фишера там не написано, что можно использовать для таблиц больше чем 2х2, так что...
А формулу найти так вообще практически невозможно!!!
Doktor.86
Цитата(100$ @ 27.11.2014 - 01:03) *
Нет, ну совсем молодежь обленилась. Ничего сами не хотят делать. Все только вынь, да положь. Хушь плачь.
Вот как делается Fisher's exact test для таблицы сопряженности произвольной размерности: Ссылка
Все это легко считается в Экселе. Не переворачивая вверх дном Тырнет в поисках халявы.
Держите нас в курсе своих успехов.


Уважаемые 100$, а точно эта формула достоверная))), я так на всякий случай, а то по книжка ее найти не смог)))
Doktor.86
Кстати провел анализ при помощи формулы по ссылке 100$, р получилось по двустороннему 0,00966, а в DoctorStat p=0,0266
С учетом, если я все правильно сделал, получилось всего 22 таблицы (с основной) и 6 значений меньше полученного при анализе основной таблицы (р=0,00364).
Есть у кого желание проверить???
100$
Цитата(Doktor.86 @ 27.11.2014 - 14:40) *
Уважаемые 100$, а точно эта формула достоверная))), я так на всякий случай, а то по книжка ее найти не смог)))


Думаю, что Стив Вольфрам на офиц. странице фуфло толкать не будет.

На нее есть ссылки из русско- и англоязычной Вики.

А вот и книжка
Doktor.86
Цитата(100$ @ 27.11.2014 - 15:14) *
Думаю, что Стив Вольфрам на офиц. странице фуфло толкать не будет.

На нее есть ссылки из русско- и англоязычной Вики.

А вот и книжка


Спасибо большое за понимание))) а то в статистике совсем не силен, прочитал только Гланца и то половину))), другие книги только просматривал...
DoctorStat
Цитата(Doktor.86 @ 12.11.2014 - 10:43) *
Прошу помочь решить проблему с сравнением 3х групп по качественному признаку, а именно:
1 группа 28 человек - 5 рецидивов.
2 группа 25 человек - 2 рецидива.
3 группа 38 человек - 0 рецидивов.
Пытался использовать точный критерий Фишера для таблицы 2хN программа DoctorStat, однако возникают мысли, а точно ли она правильно работает?
Я вычислил для Ваших данных 2-х сторонний точный критерий Фишера с помощью двух программ: моей любимой DoctorStat и всенародно любимой IBM SPSS 21. Результаты, показаные на 2-х рисунках, совпадают: P-Value = 0,012 . Ну, теперь-то Ваша душенька спокойна ?
Doktor.86
Цитата(DoctorStat @ 27.11.2014 - 22:54) *
Я вычислил для Ваших данных 2-х сторонний точный критерий Фишера с помощью двух программ: моей любимой DoctorStat и всенародно любимой IBM SPSS 21. Результаты, показаные на 2-х рисунках, совпадают: P-Value = 0,012 . Ну, теперь-то Ваша душенька спокойна ?


Спасибо большое!!! Теперь я точно уверен в Вашей программе)))
Извините за сомнения!!!
Nika_il2
Всем доброго времени суток! Искал тему, чтобы задать свой вопрос (новую создавать не хотелось), вот решил, что может в этой ветке кто-нибудь подскажет.В одной из зарубежных работ встретил интересный вариант статистической обработки данных с помощью диаграмма Эйлера - Венна (пример на скрине). Самостоятельный поиск соответствующих программ дал мало результатов - только возможность построения трех обычных кругов. В моем случае необходимо построение аналогичной примеру диаграммы . Заранее спасибо!
nokh
Цитата(Nika_il2 @ 5.02.2015 - 12:12) *
Всем доброго времени суток! Искал тему, чтобы задать свой вопрос (новую создавать не хотелось), вот решил, что может в этой ветке кто-нибудь подскажет.В одной из зарубежных работ встретил интересный вариант статистической обработки данных с помощью диаграмма Эйлера - Венна (пример на скрине). Самостоятельный поиск соответствующих программ дал мало результатов - только возможность построения трех обычных кругов. В моем случае необходимо построение аналогичной примеру диаграммы . Заранее спасибо!

Ну не знаю, гугл прекрасно находит картинки, а по ним далее есть выход на тексты - 5 мин.
В R можно такие строить:
1) Кодировать картинки, а раскрашивать вручную: http://stackoverflow.com/questions/8713994...ransparency-sup
или
2) Воспользоваться готовым пакетом VennDiagram: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/35
anserovtv
Некоторые простые диаграммы Венна можно строить даже в Excel 2010:
Вставка- SmartArt - диаграммы Венна.
Есть несколько видов. Круги можно передвигать, преобразовывать в эллипсы, поворачивать, менять заливку, размер, цвет текста.
Есть встроенная инструкция на русском языке.
Для просмотра полной версии этой страницы, пожалуйста, пройдите по ссылке.
Форум IP.Board © 2001-2025 IPS, Inc.